Examinando por Autor "Quilcate Pairazamán, Carlos"
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Ítem Caracterización bioquímica y filogrupos de Escherichia coli aislados de heces de terneros con diarrea en la región Cajamarca, Perú(Universidad de Zulia, 2022-05-31) Cabrera González, Marco Antonio; Chávez Díaz, Sámy Káterin; Gamarra Ramírez, Rodolfo Gustavo; Vásquez Pérez, Héctor Vladimir; Quilcate Pairazamán, Carlos; Cueva Rodríguez, MedaliEsta investigación tuvo por objetivo la caracterización bioquímica y la identificación de filogrupos en cepas de Escherichia coli, de heces de terneros con diarrea, mediante el método de Clermont. Se recogieron treinta y dos muestras de ocho rebaños del caserío Tartar Grande, distrito Baños del Inca, región Cajamarca, Perú. Mediante el crecimiento en agar MacConkey-MUG fueron seleccionadas trece muestras caracterizándose bioquímicamente mediante kit EnteroPluri®-Test e identificadas molecularmente mediante amplificación del gen uidA mediante la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR); se tipificó el filogrupo por PCR cuádruplex de Clermont. Las cepas locales aisladas mostraron un perfil bioquímico fermentadoras de sorbitol y glucosa permitiendo agruparlas e identificarlas en cinco grupos (códigos 71340; 71350; 51340; 61740 y 61340); además se amplificó el gen uidA que codifica la enzima beta-glucuronidasa propias del linaje de E. coli. La identificación del grupo filogenético permitió observar que están agrupadas en el grupo B1 (69,23 %), F (15,38 %), además los grupos A (7,69 %) y D o E (7,69 %) se distribuyen proporcionalmente en todas las muestras analizadas, se logró mediante amplificación de los genes arpA, chuA, yjaA, TspE4.C2. Las cepas locales aisladas de heces de terneros con diarrea representan poblaciones bacterianas naturalizadas y adaptadas al nicho ecológico de Cajamarca, teniendo la ganadería regional como principal fuente de alimentación las pasturas, posiblemente la contaminación de estas se traduce en un importante medio de transmisión en terneros para la presentación de colibacilosis, ya que estas cepas albergan la mayor proporción de genes de virulencia.Ítem Molecular identification of the most frequent pathotypes of Escherichia coli in calves with diarrhoea in the Cajamarca region of Peru(Faculty of Veterinary Medicine, University of Tripoli, 2024-09-30) Cabrera González, Marco; Quilcate Pairazamán, Carlos; Alvarez García, Wuesley; Cabrera Hoyos, Héctor; Tayca Saldaña, Antony; Aliaga Tambo, Fernando; Rojas Valdez, Deisy; Cueva Rodríguez, MedaliBackground: Colibacillosis caused by Escherichia coli causes significant economic losses in the livestock sector worldwide and is one of the calves’ leading causes of diarrea Aim: This study aimed to identify the most frequent E. coli molecularly pathotypes in calves with diarrhea in six provinces of the Cajamarca region in the northern highlands of Peru. Methods: Twenty-eight herds of dairy cattle under a semi-intensive rearing system were evaluated; 95 samples were isolated from calves with diarrhea up to the first month of life, 62 males and 33 females, during the rainy season. Results: The presence of virulence genes of E. coli strains was more prevalent in males; the astA (89.47%), st (83.15%), and f5 (57.89%) genes were more expressed, and the lt (17.89%) and stx2 (1.05%) genes were less expressed. The eae gene (21.05%) was more present in females. Conclusion: When E. coli strains express virulence genes astA, st, and f5 and their atypical double, triple, and quadruple combination between different observed pathotypes, they give rise to the formation of several pathotypes by the horizontal transfer of virulence genes, which can cause colibacillosis processes in more virulent calves, which is one of the most important causes of diarrhea in calves in the region of Cajamarca, compromising the sanitary viability in the herds.